Kirurgisen käsien desinfioinnin tulisi noudattaa periaatetta "pese kädet ensin, desinfioi sitten", joten prosessi voidaan jakaa kahteen vaiheeseen: käsien pesu ja käsien desinfiointi.

Ensimmäisessä vaiheessa "käsienpesu" ei ole vaatimusta pestä kahdesti.

Toisessa vaiheessa "käsien desinfiointi" otetaan käyttöön kaksi menetelmää:
① huuhtele käsien desinfiointimenetelmä, eli ota käsien desinfiointiaine päällystetty ja hierottu, huuhtele juoksevalla vedellä ja kuivaa, kun juoksevan veden laatu ei täytä GB5749-2006 "juomaveden hygieniastandardien" vaatimuksia, kirurgi käsineissä ennen alkoholin käsien desinfiointiaineen käyttöä ja desinfioi sitten kädet käsineiden käytön jälkeen.
② huuhtelemattomat käsien desinfiointimenetelmät, huuhtelemattomat käsien desinfiointiaineet päällystetty ja hierottu, kunnes desinfiointiaine on kuiva.

Syy siihen, onko kirurginen käsien desinfiointi kertaluonteinen vai kaksikertainen käsienpesu, on se, että "käsien desinfiointimenetelmän huuhtelumenetelmän" toista vaihetta voidaan sekoittaa toiseen "käsienpesuun". Toinen vaihe voidaan sekoittaa toiseen "käsienpesuun" toisessa vaiheessa, "huuhteluun". Itse asiassa tämän vaiheen tarkoituksena on kuitenkin desinfiointi, ei puhdistus, eikä se ole "käsienpesu".

Siksi yleensä, riippumatta siitä, mitä käsien desinfiointimenetelmää käytetään, kädet on pestävä vain kerran etukäteen. Jos hygienia on huono ja ihossa on paljon likaa, pesua suositellaan kahdesti.